教育行政研究所設有博士班與碩士班，致力於培養組織管理/教育行政/事業經營/行銷管理/非營利組織等領域之理論與實務專業人才。課程融合教育政策、行政領導、組織管理、教育法規倫理、教育評鑑等領域，運用多元化選課機制，以專業導向與需求取向強化學習成長之動能。本所博士班之專業課程實質劃分為「教育政策與領導」與「教育財經與管理」二大群組，使本所核心特色能落實於課程教學層面、實務應用層面以及學術研究層面，進而藉由多樣化的學術與實務訓練，提升學生的綜合素養與專業能力。本所畢業校友為各行各業的精英，在社會中發揮顯著影響力。